地名由来：取肇兴之源之意；另说取两肇（肇州、肇东）之本源含义；又据《中国地名由来词典》：以金太祖完颜旻在此破辽，肇基王绩得名；1936年改郭尔罗斯后旗，1956年复名。

2021年12月，农业农村部认定肇源县为全国第六批率先基本实现主要农作物生产全程机械化示范县（市、区）。

2021年11月，肇源县入选2022年水系连通及水美乡村建设试点县名单。

2021年5月，根据第七次全国人口普查结果，肇源县人口数量为33.03万人，位列大庆市各县区人口数量排行榜第2位，位列黑龙江各县市区人口数量排行榜第28位，位列全国各县市区人口数量排行榜第1630位。

2021年1月，2020年乡村振兴传播影响力县区排名发布，肇源县位列第465名。

2020年6月，肇源县列入第二批革命文物保护利用片区分县名单（东北抗日联军片区）。

2019年10月，肇源县被农业部命名为“第二批国家农产品质量安全县”。

2019年8月，紧密型县域医疗卫生共同体建设试点县名单出炉，肇源县榜上有名。

肇源县是黑龙江省大庆市的一个县原名后郭尔罗斯，位于黑龙江省西南部、松嫩两江左岸，长春、哈尔滨、大庆“金三角”的中心，隶属于大庆市。是金太祖“肇基王绩”之地，有着6000多年的文明，幅员面积4119.5平方公里。[20]肇源县一个多民族县份，21个民族，辖16个乡镇，6个农林牧渔场。根据第七次人口普查数据，截至2020年11月1日零时，肇源县常住人口为330340人。

肇源县辖8个镇、8个乡，福兴乡、三站镇、薄荷台乡、二站镇、和平乡、肇源镇、头台镇、大兴乡、浩德蒙古族乡、义顺蒙古族乡、古龙镇、新站镇、民意乡、茂兴镇、超等蒙古族乡、古恰镇。以及立陡山良种场、新立良种场、经作场、种畜场、茂兴湖水产养殖场。共有11个社区居委会、138个村委会。

肇源县气候属于北温带大陆性气候，四季分明，光照条件好，冬季寒冷干燥，温差悬殊，少病虫害。年均降水量在600mm左右，水源丰沛，处于黑龙江省第一积温带上限，年有效积温2900℃-3100℃，无霜期可达165天，作物生长季节日照总数达1295.6小时。是黑龙江省第一积温带，年有效积温2900-3100℃，气温适宜，雨量丰足，光热资源居黑龙江省之首。

肇源县属大庆油田区域，地下蕴藏着大量石油、天然气等矿产资源，2013年已探明油气总储量达7亿吨。地上有盐碱和建筑工程砂、黄粘土、火硝等。2021年8月26日，肇源县古龙镇发现了预测地质储量12.68亿吨的超大陆相页岩油田。

历史沿革：

金天会八年（1130），在出河店（今茂兴镇南“昂喇勒”古城）设置肇州。

元属辽阳行省开元路，隶属肇州屯田万户府管辖。

明属奴儿干都司，后为郭尔罗斯部游牧地。

清初，清顺治五年（1648），设郭尔罗斯后旗，隶属哲里木盟。

清光绪三十年（1904），设立北郭尔罗斯荒务行局，办理荒务。

清光绪三十二年（1906），设置肇州厅，驻“骆驼脖子”（今肇源镇）。

1934年8月，肇州县城（今肇源镇）被洪水冲毁，伪肇州县公署迁驻老城基（今肇州镇）。

同年12月，郭尔罗斯后旗改隶滨江省。

1935年8月27日，伪郭尔罗斯后旗公署由老爷屯（今肇东市四站镇东兴村）迁至肇源（即肇州旧县城，今肇源镇）。

同年9月，将肇东县第三区的大部分地区划归郭尔罗斯后旗管辖。

1945年“九三”抗日战争胜利后，初隶哈西专区，1946年3月划归吉江行政区。

同年4月，将八里、四兴（今四站镇）、向阳、三星、同仁村划归新设置的乐安县管辖；6月划归嫩江省管辖。

1947年2月至9月，由黑嫩联合省第四专区管辖。

黑嫩联合省分开后，仍归嫩江省管辖。

1949年5月，黑嫩两省合并后，归黑龙江省直辖。

1956年4月11日，国务院批准，撤销郭尔罗斯后旗，改设肇源县，县政府驻肇源镇。

1958年8月，划归松花江专区管辖。

1965年6月，由绥化专区管辖。

1992年8月21日，国务院批准，划归大庆市领导。