地名由来：以驻地东北2.2千米处的飞云江上游远近闻名的巨屿尖得名。

2021年12月，浙江省民政厅认定巨屿镇为浙江省革命老区乡镇（街道）。

2021年1月，浙江省关注森林组织委员会命名巨屿镇为“2020年度浙江省森林城镇”。

2014年6月，环境保护部授予巨屿镇2012—2013年度国家级生态乡镇称号。

巨屿镇是浙江省温州市文成县辖镇，位于县境南部，飞云江上游，距县城10.7公里。文泰公路穿境，飞云江纵贯境内。全镇总面积56平方千米，人口2.15万人（2005年）。该镇0驻云江大道，下辖33个行政村。

巨屿镇农业综合开发水果基地6100亩，蔬菜基地830亩；工业园区一期用地613亩，兴办了水泥电杆厂、高岭土厂、炼钢厂，铺筑水泥路56800平方米，修筑防洪堤2800米，兴建长2320米、宽30米的滨江大道，巨屿沙洲的开发宅基地2100间，围滩造田1043亩，村村饮用清洁卫生自来水，村村通电话、有线电视覆盖率31%；巨屿大桥、世屿尖八角亭、双方亭、包龙潭、云居寺及2240亩飞云江水域面积是漂流、旅游观光的好地方。　

砖瓦、紫砂土是该镇的主要产品。农业以种植水稻、蕃茄为主。镇0驻垟尾村。邮编：325303。

-历史沿革

1958年分别称孔龙、东垟、花前、黄龙管理区，1961年改管理区为公社，1984年改乡，1992年5月撤以上4乡置巨屿镇。　

-行政区划

1992年5月由原孔龙、花前、东洋、黄龙4乡合并建置巨屿镇。

2002年，下设4个办事处，辖稠泛、垟尾、正湾、石坦头、龙前、岭边、孔徐、金面盂、石光山、方前、刺瓜岩、岩步前、张山、潘山、徐龙、花竹岭、牛驮坪、穹口、项坑边、龙河、孔山、前山、柳一山、垟地边、葛岙底、垟西坑、东坑头、双凤、新光、新东、潘岙、双尖、赤砂33个行政村，共有159个村民小组。至2002年底，全镇总户数5750户，总人口21585人。

2003年，巨屿镇原33个行政村调整为23个行政村。黎明村由原柳一山、龙河等2个村组成；葛洋村由原葛岙底、洋西坑等2个村组成；黄龙村由原新东、新光、双凤等3个村组成；正湾村由原正湾、石坦头、岭边等3个村组成；三五新村由原石光山、孔徐、岩步前、刺瓜岩等4个村组成；张平村由原张山、牛驮坪等2个村组成；稠泛、洋尾、龙前、金面盂、方前、穹口、花竹岭、潘岙、徐龙、潘山、垟地边、项坑边、孔山、前山、东坑头、赤砂、双尖等17个村暂时保持不变。调整后，全镇下设4个办事处，辖23个行政村、199个村民小组。至年底，全镇总户数7191户，总人口20944人。

2006年，辖23个行政村：黎明、葛岙洋、龙前、金面盂、方前、穹口、花竹岭、潘岙、徐龙、潘山、垟地边、项坑边、孔山、前山、赤砂、东坑头、双尖。人口2.15万人（2005年）。

湾里岗头遗址

湾里岗头遗址位于文成县巨屿镇垟地边村。分布面积3000平方米，出土遗物仅为石制工具。器形有石凿、石斧、石环、石锛等，系打击后粗磨而成。1983年确定遗址并采集标本。根据出土器物分析，该遗址年

龟背山遗址

龟背山遗址位于文成县巨屿镇潘岙村龟背山。遗址分布在山背，面积约5000平方米，发现遗物主要有石锛和石斧两种，系砾石稍加打制而成。根据出土器物及印纹陶片分析，该遗址年代应在新石器时代晚期。