地名由来：因境内龟山、蛇山二阜之间凹入马鞍，又合称马屿山，以山名镇。

2022年8月，马屿镇入选为2022年度温州市水美乡镇。

2022年4月，马屿镇入选2022年农业产业强镇创建名单。

2021年12月，浙江省民政厅认定马屿镇为浙江省革命老区乡镇（街道）。

2021年12月，马屿镇被命名为2021年浙江省文化强镇（街道）。

2021年10月，马屿镇上榜2021年全国千强镇名单，排名第938位。

2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，马屿镇榜上有名。

2021年5月，马屿镇被列入2021年度浙江省美丽城镇建设样板创建名单（县域副中心型）。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，马屿镇榜上有名。

2019年12月，2019年度浙江省美丽乡村示范乡镇名单公布，马屿镇榜上有名。