地名由来：境内有莆田三大溪流之一的萩芦溪，故名。

2022年12月，萩芦镇被命名为2022年福建省森林城镇。

2021年2月，福建省2018-2020年度省级文明村镇社区名单出炉，萩芦镇上榜。

2020年12月，福建省爱卫办命名萩芦镇为福建省卫生乡镇。

2013年7月，农业部认定萩芦镇为第三批全国一村一品示范村镇（萩芦枇杷）。

秋芦镇位于涵江区东北部，省道五秀路旁，距莆田市区19公里，涵江9公里，距国道324线9公里，是进入莆田山区的第一个乡镇，秋芦溪（莆田第二大溪流）贯穿全境约20公里，植被保持良好，森林覆盖率达76.4%，居涵江区之冠。现有山地9.9万亩果树(批把、龙眼为主)2.5万亩。本镇年平均气温为16-20℃,有效积温为7150℃以上，最高气温为（历史）38℃,最低气温2℃,日照总数1900小时,年降雨量1500-1700毫米，无霜期350天左右,气候适宜林、果、茶、花卉、蔬菜种植。全镇面积86平方公里,人口29256人,20个行政村,侨、台胞近5000人。为莆田主要侨乡。本镇经济以农业为主,农业中果业是重点,其产值占农业产值的五分之二,主产品是龙眼、批把。己建的秋芦水果交易市场为涵江区龙眼、批把交易中心和价格中心。现有一工业小区,"三通一平"己完成。近年来,获得"省十佳生态乡镇"、"省综治先进乡镇"、"市党建先进乡镇"、"市文明乡镇"、"市信访先进乡镇"、"县项目建设先进乡镇"、等县级以上表彰20项．.

苏华故居

苏华故居位于莆田市涵江区萩芦镇官林村头份自然村。苏华(1908-2008.4)，原名黄德馥，涵江区萩芦镇人。在教会学校学习，中学毕业后当小学教员。1926年后，积极投身革命斗争，广泛发动群众

涵江江氏民居

涵江江氏民居位于萩芦镇梅阳村新厝自然村。为清监察御史江春霖（1855-1918）之故居。始建于清嘉庆年间（1796-1820），咸丰年间（1851-1861）及光绪二十一年（1895）两次扩

红军第207团驻地旧址

红军第207团驻地旧址位于莆田市涵江区萩芦镇枫山村险坑自然村。1930年，陈天章率领红军第23军第207团驻扎在枫山村险坑三官堂，发动群众开展斗霸分粮斗争，并在三官堂墙上书-写革命宣传标语

历史沿革：

辖境在宋、元属武化乡兴教里和唐安乡待贤里；明、清时期属莆田县三区待贤里、兴教里；民国时期属莆田县广业区。

中华人民共和国成立后，先后属莆田县新县里、待贤区、十二区、十一区、涵江区；1992年改为莆田县萩芦镇。

2002年划归涵江区管辖。