阿合奇县辖镇，县府驻地。1962年成立吾曲公社，1969年更名红旗公社，1984年改设阿合奇镇。面积3.6平方公里，人口0.7万，有柯尔克孜、维吾尔、汉等民族，其中柯尔克孜族占54.27％。辖吾曲、皮昌、加郎奇3个村委会。镇东部2公里处，有吾曲古城遗址。