地名由来：因位于花沟流入芡河处得名花沟集，简称花沟。

2019年7月，花沟镇入选2019年全国农业产业强镇建设名单。

花沟镇位于涡阳县城西14公里，东邻S307省道，曹淝路、耿王路穿境而过，环境优越，交通便捷。几年来，我镇在县委、县政府的大力支持下，各项工作均取得了辉煌的成绩。2002年以来，我镇连续三年被市评为“农田水利基本建设先进单位”，同年又被市信访局评为全市“六无”乡镇。2004年被市委评为“党委系统督查工作先进单位”。

全镇耕地面积7.3万亩,人口5.6万，辖154个自然庄，16个村委会。我镇土地肥沃，生产条件优越，适宜了多种农作物生长，资源丰富。经过多年的治理，沟、河、田、林、路综合配套。全镇工、农业生产总值，财政收入，农民纯收入大幅提升，工农业总产值2005年增加到1.8亿元，年递增9%，人均纯收入实现2455元，我镇还采取“跳出农业抓农业，抓好农业促多业”的经营理念，使花沟经济腾飞注入了活力。名特优产品颇丰，优质小麦，大豆、玉米、棉花、药材是重头戏、食用仙人掌、红芋、三粉加工，新鲜蔬菜是名特优产品。生产中实行“三化”种植，即种子优良化、种植区域化、管理科学化。使农业抗灾抗风险能力增强，连年获得丰产丰收，农业的丰产丰收促进了全镇的山羊、奶牛、生猪、肉鸡、肉鸽、家庭规模化养殖，全镇养殖场5个，年产值150万元，同时也促进涉农企业发展，通过招商引资，内引外联，镇积极开展百姓创家业，能人创企业，干部创事业，全民创业活动，办起了五家中型面粉厂，四家建材厂，年加工面粉2000吨，远销东北、上海等地，就地年消化小麦3000万吨，企业年产值2000万元，企业发展带动了商业，运输业、服务业的发展，实现了多业并举，百业兴旺的可喜局面。

几年来镇党委、政府有序组织全镇农村剩余劳动力外出务工，发展劳务经济。全镇长年外出务工人数达三万人，镇做好外出务工人员的土地流转、转包等工作，使他们安心务工，大大增加了农民收入。

加快农村城市化，城乡一体化进程，抓好新农村建设。首先抓好三个小集镇的建设和规划：1、花沟集经过镇政府科学规划，由原来的“二纵二横”街道，规划建成现在“五纵四横”九条街道，占地面积1.5平方公里，宽阔的柏油路街道两旁，楼房矗立，店铺鳞次栉比，街道整洁，绿化、亮化、净化。集镇建有八大专业市场、经营有序，繁华而具有现代化气息。孙小桥集和孙瓦集也已规划建设成宽阔、整洁、文明的小集镇，全镇已铺山石路50余公里。

历史沿革：

1961年划为公社，属花沟区辖。

1969年并为县辖公社。

1979年又划为标里区辖公社。

1983年6月改称为花沟乡。

1992年，撤区并乡，花沟乡、姜大乡和信辛乡合并设立花沟乡。

1997年撤乡改设花沟镇。