地名由来：古称龙王庙集，因明朝末年这里连年大旱，农民为求雨修建龙王庙而得名，又因此处多水洼地，盛产芦苇，以芦远名于外乡，称芦家庙集，后演化成今天的芦庙集。

2019年5月，芦庙镇被授予2018年度安徽省森林城镇称号。

亳州市辖镇。1969年设王楼公社，1983年改乡，1992年撤区并乡，王楼、芦庙两乡合并为王楼乡，1994年更名为芦庙镇。位于市区北13公里，东北接河南省虞城县，西北接河南省商丘县。面积69平方公里，人口3.3万。京九铁路纵穿镇境，亳(州）王(楼）公路通市区，西临105国道。辖黄庄、雷庄、前毛、后于、后杜、杨庄、河东、大武、董六、董楼、袁庄、三里湾、王楼、李双井、黄寨、减厂、焦楼、夏武营18个村委会。以农业为主，产小麦、玉米、烟叶、棉花等。乡镇企业有桐木加工厂、轮窑厂等。

历史沿革：

1969年属王楼公社。

1979年设张集区王楼公社。

1992年撤区并乡，王楼乡、芦庙乡合并成立王楼乡。

1994年更名为芦庙镇。