地名由来：因镇政府原驻地位于店子村，故名店子镇。据《刘氏族谱》记载：明洪武四年（1371），刘姓由河北省枣强县迁入，以开店为业，后因店铺兴盛，更名店子庄；1912年曾名店子镇；建国后简称店子。
2023年3月，农业农村部推介店子镇为2022年全国乡村特色产业产值超十亿元镇（西红柿）。
2023年2月，店子镇被确定为第三批山东省教育强镇筑基试点乡镇。
2021年12月，山东省农业农村厅认定店子镇为2021年山东省级农业产业强镇。
2021年10月，农业农村部遴选推介店子镇为2021年全国乡村特色产业十亿元镇。
2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，店子镇榜上有名。
2020年11月，农业农村部推介店子镇为2020年全国乡村特色产业十亿元镇。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，店子镇榜上有名。
2018年12月，山东省文明委推选店子镇为2018年度山东省省级文明村镇。
2013年7月，农业部认定店子镇为第三批全国一村一品示范村镇（博绿西红柿）。
店子镇位于博兴县东南部，南临淄博市，东与东营市接壤。全镇辖38个行政村，4.6万人口，党员2073人，总面积86平方公里，耕地8.3万亩。2013年实现地方财政收入6488万元，其中国地税分别完成2355万元和2531万元，增幅分别为38.4%和19.3%。
店子镇是闻名遐尔的“中国优质西红柿之乡”。2013年被农业部命名为“全国一村一品示范镇”，“博兴西红柿”国家地理标志证明商标认证工作已通过国家工商总局公示核准。全镇拥有标准冬暖式蔬菜大棚12000余个，农产品60%以上出口到俄罗斯、日本、韩国、新加坡等国家和地区，年可实现产值1.8亿元，纯收入1.3亿元，人均占有2750元。店子镇工业园总面积8.3平方公里，形成了“五纵四横”的路网框架，入园企业115家，其中规模企业30家，从业人员5000余人。经过多年发展，全镇初步形成新型建材业、机械加工业、物流服务业、油棉加工业四大优势产业，培植壮大了蓝天钢板、汇金彩钢、瑞帆果蔬机械、鑫辉仓储物流等一大批品牌龙头企业。
2014年是店子镇实现赶超跨越发展的关键之年。通过博兴番茄产业示范园、店子镇污水处理厂、店子镇中心小学（幼儿园）等重点工程带动，店子镇将全面开启南扩工业区、西拓城镇区、北进农业区发展步伐，进一步提高工业园区承载力，拉开现代农业示范区和新型城镇区建设的帷幕。2014年全镇主要预期目标是地方财政收入突破7500万元，完成固定资产投资21亿元，新引进过5000万元项目5个、过亿元项目2个，农民人均纯收入达到12000元。
历史沿革：
隋唐时期属博昌县。
五代后唐始属博兴县。
明清属东姑乡、贝丘乡。
民国为五区。
1958年6月设利城公社。
1961年复改利城区。
1968年改店子公社。
1984年改店子乡。
1994年改建店子镇。