地名由来：清同治年间（1862~1874年），水南圩所在地位于大迳河、清湾河和社坑河汇合处，故称河口圩。后为了与三水县河口区别，改名水南圩，取大迳河水自此由北向南流之意。

2021年9月，广东省农业农村厅公布第三批广东省“一村一品、一镇一业”专业镇名单，水南镇榜上有名（蜂蜜）。

2018年10月，广东省林业局认定水南镇为2018年广东省森林小镇。

水南镇位于高要市北部，镇域东北与广宁、四会两县市交界，西南分别与本市的乐城、禄步等镇接壤，县道平宾(禄步平水至广宁宾亨)线横贯其中，距肇庆仅50公里，距广州150多公里，全镇实现了村村通水泥硬底化道路。全镇总面积126平方公里，其中山地面积16.8万多亩，耕地面积4500多亩。辖14个村民委员和1个社区居委会，130个村民小组，总人口1.4万多人，其中镇城区非农业人口1010多人。主要姓氏有陈、甘、赖、杨、钟、苏、卢等。

2006年全镇实现国内生产总值10350万元，比增5%；工农业总产值13104万元，比增5%；财政税收入库179.8万元，比增112.8%；招商引资取得突破性发展，签订项目合同3100万元，实际引进民营资金1500万元；社会固定资产投资总额985万元；农村人均纯收入4938.5元，比增3.9%。

水南镇矿产和土特产资源十分丰富。高品位的瓷土储量大，土特产以肉桂、石槁（香粉）、深山蜂蜜、松香、南药佛手、柑桔(沙糖桔、贡柑)等为主要产品。

历史沿革：

民国二十六年（1937年），水南镇境域属一区大迳乡。

民国三十二年（1943年）10月，设平南乡。

1950年，建立水南乡人民政府。

1958年10月，与中源、河台联合成立乐城公社。

1959年7月，析置水南公社。

1983年1月，公社改区。

1986年，水南区改水南镇。