地名由来：俗话说，天上方一日，人间已百年。观音菩萨三日聚会结束，当返回南海又途经此地时，再次按下祥云往下一看，却发现她上次划出的河沟北边又居住了人烟，而且是一片低矮的茅草小屋，衣着破烂的穷苦的人家。于是她手指一动，在居住人烟和乱葬岗子之间又划了一道河沟，这就是现存北边的那条河沟。这条河沟，观音菩萨是自东向西划的，所以水流的方向也是向西的。后来，随着集市面积的不断扩大，自然地把原来的几个小村庄连到了一起，原来几个小村庄的名字也就分不清了。那些做生意的远近客商，也就自然称呼这里为双沟集，久而久之，双沟的名字就这样叫开了。

2023年1月，江苏省爱国卫生运动委员会命名双沟镇为2022年度江苏省卫生镇。

2021年10月，双沟镇上榜2021年全国千强镇名单，排名第840位。

2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，双沟镇榜上有名。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，双沟镇榜上有名。

2019年10月，2019年度全国综合实力千强镇榜单公布，双沟镇位列第836名。

2018年3月，江苏省环保厅公布双沟镇为首批江苏省生态文明建设示范镇村。

2014年7月，双沟镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。

双沟镇畜牧业和林果业十分发达。双沟于1996年发展波尔羊产业，到2003年全镇的年饲养量已达到20万只，其中杂交波尔羊饲养量达到11万只，山羊产值达到2550万元，养羊业成为农民增收的重要来源，成为农业主导产业之一。镇内有专业山羊交易市场2个，山羊专业屠宰村2个，日屠宰量能达到1千只，成立了羊业协会，把千家万户的小生产和千变万化的大市场有效衔接起来，提高了农民进入市场的组织化程度。

奶牛生产。到目前全镇奶牛已发展到近5000头，主要分布在上坝、大赵、胥湾等村，成为睢宁县奶牛饲养第一镇。上坝是奶牛养殖专业村，全村有奶牛近3000头，年产鲜奶10000吨，销售额近2000万元，极大地富裕了当地的群众。目前镇内共有维维、绿建、卫岗等鲜奶收购站4个，专业奶业生产公司一家。

全镇生猪饲养量达6万头，其中三元猪4万头；家禽126万羽。

双沟镇林业生产十分发达。沟、渠、路、林全面配套，形成了极为完善的农田防护林系统工程，林网面积达35万亩，四旁植树28万株，全镇成片种植意杨4万亩，主要品种为69、72，林业的发展带动了全镇板材加工业的蓬勃发展。

双沟镇是优质日本梨的主产地之一，主要品种有：三水、新高、爱宕，目前种植面积有12220亩，群众栽植日本梨获得颇为可观的经济利益。

全镇目前小麦总面积34000亩，其中优质麦15000亩；设施菜5000亩；棉花16000亩，其中产品质棉10000亩；花生面积14000亩；花卉苗木3000亩；桑园面积5450亩，蚕茧收购站两个。

历史沿革：

自1987年2月设立双沟镇以来一直隶属于睢宁县。