地名由来：小坝子镇因镇政府驻地村南有一块小平地而得名。

2022年2月，云南省爱卫办命名小坝子镇为2021年度云南省卫生乡镇。

小坝子镇位于马关县南部边缘，是一个集边疆、民族、贫困、山区和原战区为一体的乡镇，镇人民政府驻地距马关县城36千米。镇情主要有五个特点：一是沿边区位优势明显。小坝子镇与越南新马街、猛康两县隔河相望，国境线长38.6公里，北靠仁和镇和红河州河口县，全镇总面积为128平方公里，有沿边村小组14个855户5536人，有通往越南的3个便道（大梁子、呜哩和岩龙）和一个通道（黑河渡口），沿边区位优势明显。二是民族众多。下辖4个村委会73个村民小组3599户15510人，境内居住着汉、壮、苗、彝、瑶等9种民族，少数民族人口占总人口的87%。三是海拔落差大，热区资源丰富。境内最高海拔2042米，最低海拔173米，海拔落差1800余米，可开发的热区近1.5万余亩，主要种植香蕉、小米辣等热区经济作物，目前，已开发种植种植香蕉8690亩，甘蔗1500亩，小米辣235亩。四是雨量充沛，水能资源丰富。全年无霜期350天以上，年降雨量1400毫米左右，年平均气温17℃，水能资源较为丰富，主要河流有斋河、大梁子河、南浦河，已建成使用拉气电站一个，总装机5万千瓦，在建南浦河电站一个，总装机容量1.0万千瓦。五是贫困面大，贫困程度深。2017年通过动态管理，锁定建档立卡贫困户1290户4857人，未脱贫建档立卡贫困户908户3359人。2017年末，2017年末，全镇农村经济总收入达8252万元，同比增长7.7%；农村常住居民可支配收入达6086元，同比增长11%；畜牧业总产值达3762万元，同比增长10%；实现粮食总产量7663吨，同比增长8.6%；实现农民人均有粮397公斤，同比增长3.3%；各项金融存款达13159万元，同比增长16.5%，各项贷款达4069万元，同比增长15.1%。全镇呈现出经济发展、社会进步、和谐稳定的良好局面。

历史沿革：

1949年，设小坝子镇。

1952年6月，改为第六行政村。

1955年7月，改区。

1959年3月前，属河口县。

1959年，划归马关县，称特别区。

1969年，改公社。

1984年，公社改区。

1988年，区改镇。