地名由来：相传，清朝此处建有一座土结构草顶的三官庙，该镇因此得名。

2022年2月，安徽省爱国卫生运动委员会命名草庙镇为2021年度安徽省卫生乡镇（街道）。

2019年5月，草庙镇被授予2018年度安徽省森林城镇称号。

泗县辖镇。1949年设草庙乡，1961年设公社，1980年改区，1992年撤区并乡时改镇。位于县城东，距县城7.5公里。面积66.7平方公里，人口2.2万。泗(县）宿(州）公路穿境。辖草庙、大贺、王岗、大刘、湾里圩、于圩、宋岗、魏圩、张沟、三蒋、通海、簸姚、关里、大位、治岗、徐岗16个村委会。以农业为主，产小麦、玉米、大豆等。乡镇企业有砖瓦厂、造纸厂、海棉厂、粮食加工厂。

历史沿革：

草庙镇历史上属泗县。

1980年1月设区划社时，由原东方红公社、红旗公社合并为草庙区。

1986年至1992年2月，草庙区境内辖通海乡、草庙乡、三湾乡、汴光乡。

1992年3月撤区并乡时，三湾乡划为独立乡镇，汴光乡划归泗县城关镇，草庙区改名为草庙镇。