地名由来：因镇境内有玉峰山（又名马鞍山），山中产“昆石”洁白如玉，晶莹别致，史有“玉山”之称。镇由此得名。
2022年9月，2021中国百强镇名单揭晓，昆山高新区（玉山镇）位列第1位。
2021年10月，昆山高新区（玉山镇）上榜2021年全国千强镇名单，排名第1位。
2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，昆山高新区（玉山镇）榜上有名。
2021年9月，昆山高新区（玉山镇）上榜2021中国高质量发展百强镇，位列第3。
2021年9月，昆山高新区（玉山镇）被认定为第二批全国乡村治理示范乡镇。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，昆山高新区（玉山镇）榜上有名。
2019年10月，2019年度全国综合实力千强镇榜单公布，昆山高新区（玉山镇）位列第1名。
2009年1月，昆山高新区（玉山镇）上榜第二届全国文明村镇名单。
玉山镇是昆山市（全国百强县榜首）的政治、经济、文化和商贸中心，她既是一个拥有深厚文化底蕴的江南名镇，又是一个具有悠久历史的水乡古镇，还是一个以发达的外向型经济与民营经济著称的现代化工商业重镇。全镇区域面积118平方公里，人口17.3万人，下辖6个街道办事处、49个社区居委会、22个行政村，是2006年国家统计局公布的全国千强镇评比第一名、全国群众体育运动先进乡镇、全国创建文明村镇工作先进村镇、全国亿万农民健身活动先进乡镇。
玉山镇交通十分发达，区位优势明显。京沪铁路穿越镇区，每天来往的车次有80班，春运高峰时达到120班；区域内公路路网健全，沪宁高速公路、机场路、312国道、339省道穿境而过；与上海虹桥机场相距仅45公里，半小时就可到达，到浦东国际机场也只有一个小时的车程；上海港、张家港、浏家港三个港口，最远的一小时，最近的半小时，娄江、张家港、青阳港等主航道纵横交错，通江入海。
玉山镇由原玉山、城北和原正仪镇、陆杨镇部分地区合并而成，全镇上下紧紧围绕经济建设、社会发展这个中心，主动承接国际产业资本转移，形成了以外向为特色，以现代制造业为主导的开放型经济格局，主要经济指标以每两年翻一番的高速度增长。
2006年，玉山镇继续坚持与时俱进，不断进取争先，以科学发展观为指导，围绕“两个率先”和建设“全国一流强镇”的奋斗目标，坚定不移实施“外向带动、民营赶超和服务业跨越发展”三大发展战略，全镇经济社会取得了长足发展。全年完成国内生产总值185亿元，地方一般预算收入19.5亿元，城镇居民人均可支配收入19010元，增长12%；农民人均纯收入10871元，增长10.5%。
玉山镇将严格按照国际惯例，信守承诺，全面加强与投资商的合作交流，致力打造平安昆山、电子昆山、效率昆山、绿色昆山和魅力昆山，为把昆山建设的更加美丽，为广大外商朋友提供更为广阔的发展空间而努力奋斗。
历史沿革：
秦属会稽郡娄县。
梁天监六年（507）属信义郡信义县，大同二年（536）属昆山县。
唐天宝十年（751）昆山县治移此。
元朝为昆山州治。
清雍正二年（1724）分昆山县置新阳县，分属2县，为两县县治所在地。
宣统二年（1910），分属玉山市及巴城、周墅、陆家桥、正义、蓬阆等乡。
1912年，属昆山县。
1929年，境分属昆山县第一、第二、第八、第九、第十区。
1947年，境分属玉山镇及城北、城南，茜步、正义、南星、夏溪等乡。
1949年5月，属昆山县城区。
1956年9月，为县属玉山镇。
1958年，城北、城南乡与玉山镇合并建马鞍山公社。
1959年6月，撤马鞍山公社分建玉山镇。
1986年10月，城南乡并入玉山镇。
2000年8月，城北镇并入玉山镇。
2003年12月，正仪镇娄江以南7个村和陆杨镇西南部（杨林塘以南）3个村并入玉山镇。
2012年，经批准，昆山高新区与玉山镇实行“区镇合一、以区为主”管理体制，保留玉山建制镇。