地名由来：因该镇原驻地村系取自瀚溪、仙磜两个自然村地名的首字，故名。

2022年10月，福建省农业农村厅认定瀚仙镇定为第二批福建省乡村治理示范村镇。

2021年12月，瀚仙镇被命名为2021年度福建省森林城镇。

2021年2月，福建省2018-2020年度省级文明村镇社区名单出炉，瀚仙镇上榜。

2020年12月，福建省爱卫办命名瀚仙镇为福建省卫生乡镇。

2008年4月，环境保护部授予瀚仙镇第七批全国环境优美乡镇称号。

明溪县辖镇。1950年称龙湖乡，1969年属雪峰公社，1981年改瀚仙乡，1９９５年置瀚仙镇。位于县境东部，距县城６公里。面积1５０平方公里，人口1．２万。省道1０２线和２０６线于此交会。辖石珩、小眉溪、瀚溪、龙湖、大焦、连厝、洋龙、花园、坪地、岩里、王陂11个村委会。农业主产水稻、豆类、油菜籽、茶叶、烤烟。乡镇工业有建材、建筑、采矿、食品、化工、运输等。宋代理学家杨时生于此镇龙湖村。

归化战役纪念碑

归化战役纪念碑位于明溪县瀚仙镇龙湖村东北2公里铁岭隘。1934年3月22日，国民党东路军第10师（师长李默庵、驻将乐白莲）、第52师（师长卢兴帮、驻永安）共1万多人，在空军支援下，由将乐白莲

龙湖文庙棂星门

龙湖文庙棂星门位于明溪县瀚仙镇龙湖村，年代为明。简介：建于明弘治六年（1493），明万历十九年（1591）重修，坐南朝北，由并列三组石牌楼组成，石牌楼为双柱单间冲顶式结构，石柱前后侧设有抱鼓

历史沿革：

瀚溪，宋代属将乐县兴善里，明、清两代境内岩里、洋龙、坪地、龙湖、瀚仙、连厝、花园为原将乐县兴善里，王陂、大焦、石珩、小眉溪为原清流县归上里，1939年称龟山乡，中华人民共和国成立后称二区龙湖乡。

1956年三月,明溪两县合并后划入三明县，1958年成立上游人民公社，1959年将上游人民公社改为雪峰公社，1961年11月三明市、三明县分治后，为三明县雪峰公社。

1964年春恢复明溪县，划归明溪。

1969年6月析分为城关、雪峰两个公社，雪峰社址迁至瀚仙大队瀚溪村。

1981年6月更名为瀚仙公社。

1983年更名瀚仙区，1987年更名瀚仙乡，1995年更名瀚仙镇。

焦、石珩、小眉溪为原清流县归上里，1939年称龟山乡，中华人民共和国成立后称二区龙湖乡。

1956年三元,明溪两县合并后划入三明县，1958年成立上游人民公社，1959年将上游人民公社改为雪峰公社，1961年11月三明市、三明县分治后，为三明县雪峰公社。

1964年春恢复明溪县，划归明溪。

1969年6月析分为城关、雪峰两个公社，雪峰社址迁至瀚仙大队瀚溪村。

1981年6月更名为瀚仙公社。

1983年更名瀚仙区，1987年更名瀚仙乡，1995年撤乡设镇，更名瀚仙镇。