地名由来：古时吴山多姓，南宋末年，陈、吴两姓人口剧增，故以两大姓氏为名，叫陈吴，又因该村四面环山，民国时正式定名为吴山，故名。

2020年12月，福建省爱卫办命名吴山镇为福建省卫生乡镇。

2014年9月，环境保护部授予吴山镇2012年—2013年度国家级生态乡镇称号。

2012年11月，农业部认定吴山镇为第一批全国一村一品示范村镇（仙顶茶叶）。

大田县辖乡。1９８４年建吴山乡。位于县境南部，距县城２９公里。面积9３．３平方公里，人口０．９万。省道新集公路贯穿乡境。辖吴山、张坑、科山、锦山、梓溪、和洋、程堂、东埔、阳春９个村委会。农业主产水稻、红薯。

历史沿革：

明清属德化县尤中里彭溪社，民国时是德化县济屏乡吴山保，1943与屏山、济阳同属济屏乡；1950年8月由德化县划入大田县属第六区，1958年属屏山公社，1961年单独成立吴山公社，1970年复属屏山公社，1972年恢复吴山公社，1984年撤公社建立吴山乡。

2017年12月15日撤乡设镇称吴山镇，并沿用至今。