地名由来：据传，元朝初期，田、魏两家居此，一家在古道旁开店为业，因店小，习称小店，后成村名。

2022年1月，小店镇被确定为第二批山东省教育强镇筑基试点乡镇。

2021年12月，山东省农业农村厅认定小店镇为2021年山东省级农业产业强镇。

2020年5月，小店镇被确定为2020年农业产业强镇建设名单。

2018年12月，山东省文明委推选小店镇为2018年度山东省省级文明村镇。

2015年8月，农业部认定小店镇为第五批全国一村一品示范村镇（文心绿芦笋）。

莒县小店镇地处鲁东南，日照市西60公里，地理坐标为东经118°50′，北纬35°21′，辖62个行政村，人口5.7万，对空面积120平方公里，地势东高西低，土地肥沃，气候温和，年平均气温12.3℃，降水量840mm,所产“文心绿”牌绿芦笋驰名中外，是江北最大的绿芦笋生产基地。

区位优势明显，基础设施完善。小店镇东邻日照港，西靠206国道，北距日东高速公路仅2公里，距-公路60公里，225省道穿境而过，镇内62个行政村全部实现了村村通水泥硬化路，交通快捷方便；镇内电力供应充足，拥有35KV变电站一座；通讯发达，网通、移动、联通在境内无缝覆盖；各种服务设施齐全，教育、文化、卫生事业先进。

物产资源丰富，经济发展迅速。近年来，镇党委政府坚持以科学发展观为指导，按照招商引资富财政，特色农业富农民的工作思路，紧紧抓住经济建设这个核心，发挥三大资源优势，努力做好了三篇大文章。

特色农业产业产业优势明显，小店镇以“一绿两红”（芦笋、草莓、油桃）为主的特色农业总面积已发展到4.5万亩，其中绿芦笋面积就已达到2万亩，年产“文心绿”牌优质成品笋2.6万吨。围绕推进产业优势向经济优势转变，镇党委政府规划建设了农产品加工基地，目前全镇拥有各类农产品加工企业5家，其中规模以上企业3家，果蔬保鲜库达9家，总储藏能力1650吨。

花岗岩石资源丰富，总储量达5亿立方米，所产“莒州红”系列产品已销往北京、西安、济南、莱州等大中城市，市场前景十分看好。2004年，镇党委政府适应石材产业发展的需要，坚持规范和发展并举，规划建设了全长10余里的石材加工长廊，着力构筑山上有序开采，山下精深加工的集约化开发格局。目前已发展石材加工企业37家，上石锯63台，实现年产值5000万元，利税600万元，石材加工业步入了发展的快车道。

页岩黏土储量丰富，镇内沿225省道，3公里的丘陵地带蕴藏着3亿多方的优质页岩黏土。近年来，镇党委政府抓住砖瓦市场看好的有利时机，多措并举，营造了良好的投资环境，先后发展砖瓦建材企业16家，砖瓦建材产业成为促进农民增收，财政增长的重要产业。