地名由来：明朝时期有飞来之磨，落于该地，恰巧有一伙强盗在此分赃，头被此磨砸得粉碎，而得名“磨头”。1985年经江苏省人民政府批准撤乡设镇。

2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，磨头镇榜上有名。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，磨头镇榜上有名。

2020年7月，全国爱国卫生运动委员会重新确认磨头镇为2020年国家卫生乡镇（县城）。

2018年3月，江苏省环保厅公布磨头镇为首批江苏省生态文明建设示范镇村。

2011年10月，环境保护部授予磨头镇2011年国家生态建设示范区之“全国环境优美乡镇”称号。

如皋市辖镇。1949年设磨头乡，1957年由仁静、磨头、徐石3乡一部分并为磨头乡，1958年改公社，1983年复乡，1986年建镇。位于市境中部，距市府12公里。面积37.1平方公里，人口3.3万。如海运河、丁磨公路、204国道过境。辖磨北、天阳、吴曹、丁郭、东冒、西冒、肖石、范荡、曹田、董堡、南屋、邓庄、星一、严堡、大狄、八角、赵港、星光、磨南、小磨、宋渡、王户、小狄23个村委会。农业主产玉米、小麦、花生、山芋、豆类。特产胡萝卜、东串猪。企业有巢丝、农具、机械、绣花等。镇区东侧有苏中皋南战斗烈士陵园。是明书法家贾鸣凤、近代老同盟会会员沈卓吾的出生地。

历史沿革：

清光绪年间因人口达四万以上而称磨头市；民国时为如皋市第十一区；1946年为如皋市第九区，1949年改称磨头区，1958年成立磨头人民公社；1983年改为磨头乡；1985年撤乡建镇。

2001年10月6日，依皋政发〔2001〕235号文件，将磨头镇与场北乡合并，设立新的磨头镇沿用至今。