地名由来：百合镇因驻地在百合街而得名。百合街（百合村）历史悠久，建于明代初期，最初叫“博合”，古代这里的鳌山书院，学子们博学多才，再加上四面八方的客商汇集于此，因此得名。

百合镇位居横县东部，为三地四市（横县、灵山、浦北、贵港）交界要冲，面积186平方公里，辖27个村委会、1个社区和一个航运公司，共113个自然屯。全镇耕地面积6.67万亩，有林面积10.6万亩。黑皮果蔗种植、芝麻饼生产、竹编、草席、木器加工为本镇特色经济。黑皮果蔗种植面积达2.3万亩，总产16万吨，年收入5000多万元。矿产资源主要有石灰石、高岭土等。现已形成水泥、红砖、石灰三大支柱产业，其中，有年产水泥20万吨厂家2个，日产生石灰50吨以上厂家10个，红砖厂11家，"百鳌牌"水泥、"百利牌"生石灰粉产品畅销。2002年国民经济主要指标完成情况：国内生产总值24285万元；固定资产投资总额3453万元；农业总产值28600万元；农民人均纯收入2022元；工业总产值3269万元；粮食总产值26693万吨；乡镇企业总产值25631万元；财政一般预算收入849.6万元；年末总人口97694人，人口自然增长率6.98‰该镇在1999年实现了村村通汽车，村村通电话，村村通广播电视，百合中心卫生院是南宁地区乡镇级首家一甲医院。百合镇的农业以水稻为主，主要经济作物有糖蔗、黑皮果蔗。黑皮果蔗每年种植面积1．8万亩左右，总产12．6万吨，产品远销河南、湖南、河北、湖北、陕西、四川、、重庆等省市。工业以建材为主，有水泥厂2家，年产水泥20万吨，红砖厂11家，日产50吨石灰厂10家。

鳌山寺（鳌山书院）

鳌山寺（鳌山书院）位于横县百合镇百合社区鳌山山脚下百合中学内，时代为清咸丰同治年间1851-1874，类别为古建筑。2012年，鳌山寺（鳌山书院）被公布为横县文物保护单位。

历史沿革：

清属横州。

1958年，设百合公社。

1962年，设百合区。

1968年，百合区复改为百合公社。

1984年10月，百合公社撤销改设百合镇。