地名由来：因很早以前，胡、周、郑三户在此开设店铺，经营日杂、饮食、客栈，供来往客商食宿，生意较兴隆，寓“三元开泰”、“三元及第”吉利之意，故名。

2022年1月，三元镇被命名为2021年度安徽省森林城镇。

三元镇，位于安徽省六安市叶集区。三元镇总面积89平方公里，辖10个行政村，184个村民组，三所敬老院，人口3.16万，可耕地面积3.7万亩。地理位置优越，交通便捷。三元镇地处安徽西部，大别山北麓，淮河以南，长江以北，居于江淮之间，丘陵地貌，属亚热带季风性气候，季风明显，四季分明，气候温和，雨量适中，春暖多变，秋高气爽，梅雨显著，夏雨集中。全年平均气温为15.43℃，无霜期年平均222天，年平均降水1170毫米。便捷的交通条件使得三元镇活力四射，与宁西高速、合武高速、商景高速、宁西铁路、沪汉蓉高铁、105国道、312国道相邻，至合肥骆岗机场仅1小时路程，310省道由北向南穿镇而过，县乡公路网相互交错，“村村通”水泥路互通全镇。

历史沿革：

1949年以前，称三元店。

1949年建三元乡。

1958年成立人民公社时为红旗人民公社。

1961年为三元人民公社。

1983年秋复建三元乡，属霍邱县。

2014年6月28日撤乡建镇，为三元镇，属霍邱县。

2015年属叶集区至今。