地名由来：《彭泽县志》记载：“芳湖口有浮云墩，周廻三百步，随江水涨落而名浮云墩（早废），”后因“浮云”在当地移民口中谐化成“芙蓉”而得名。地名含义为地处芙蓉墩的镇。

2022年3月，江西省爱国卫生运动委员会命名芙蓉墩镇为2021年度江西省省级卫生乡镇。

芙蓉墩镇位于江西省彭泽县西南部，紧邻县城，是长江沿岸的一颗明珠，魅力四射的一方热土，是全国的优质棉基地.2001年撤乡并镇，现镇区面积146平方公里，3.2万人口，辖12个行政村，1个居委会。湖牛公路穿境而过，正在修建的铜九铁路贯穿全镇，全镇长江沿线长12公里，水陆交通十分便利。

芙蓉墩镇物华天宝，人杰地灵，全镇森林覆盖率达60%，山林面积2万余亩，水面4万余亩，山川秀美，气候宜人。

长风劲道千帆远，热情跨越万象新。沐浴着思想解放的浩荡东风，伴随着江西崛起的豪迈脚步，改革开放以来，特别是近几年来，勤劳智慧的芙蓉人民在彭泽县委，县政府的正确领导下，紧紧围绕“三增一稳”目标，解放思想，与时俱进，抢抓机遇，加快发展，开创了各项工作的新局面，经济、社会发展进一步加强。

通过主攻招商引资，运作企业抓支柱，坚持不移地推进产业化进程，目前已有同正科技、昌华公司、大丰棉纺、诺伊尔药业、国财汽运公司等多家企业落户该镇。镇境内有着丰富的山水和砂矿资源，以及极具开发价值的江中岛鹿科动物繁殖及生态旅游项目，发展潜力巨大，可满足创办各种家具厂和竹器编织厂原料的供给。江中岛的生态旅游项目已得到香港红旗集团的评估认可，经济效益可观。2000余亩的湖滩水草茂盛，资源丰富，适合创办各类养殖场。

改革春潮涌，发展正逢时，芙蓉墩有优势，有潜力，有希望。开放的芙蓉墩欢迎四海宾朋，八方宾客携手共谋大业。

历史沿革：

1949年前芙蓉属双峰镇、陶狄、安复等乡。

1951年分属4区（太平区）的定山、1区（城关区）的城郊、芙蓉、凉亭等乡。

1953年成立34个初级社，1956年转为9个高级社。

1958年始设芙蓉人民公社。

1984年名芙蓉墩乡。

1993年更名为芙蓉墩镇，沿用至今。

2001年撤乡并镇将湖西乡并入。