地名由来：尼山，古名尼丘山。因孔子生于此，又名丘，后世为避圣讳，改名为尼山。
2023年1月，尼山镇被命名为2022年度山东省精品文旅名镇（乡村旅游重点镇）。
2021年10月，尼山镇被确定为山东省旅游民宿集聚区创建单位。
2020年3月，尼山镇入选2019年度山东省省级耕地保护激励乡（镇、街道）。
2019年12月，尼山镇被认定为第一批山东省乡村振兴示范乡（镇、街）。
2017年8月，尼山镇被国家住房和城乡建设部认定为第二批全国特色小镇。
2014年9月，环境保护部授予尼山镇2012年—2013年度国家级生态乡镇称号。
2013年8月，尼山镇获评第三批山东省历史文化名镇名村。
南辛镇是中国古代伟大的思想家、教育家、政治家、儒家学派的创始人孔子的诞生地，是2000年12月因乡镇规模调整由原尼山乡、原南辛镇合并组成的新乡镇。合并后的南辛镇位于曲阜市东南部，西距曲阜市区15公里，南、东接邹城市，东北邻泗水县，为三县市交界处的政治、经济、文化重镇。全镇总面积101平方公里，总耕地面积6.4万亩，辖6个管理片，42个行政村，总人口5.3万人。
南辛镇南、北、东三面环山，中西部为平原，地势东高西低，南高北洼。主要有尼山、昌平山、四基山、盘龙山、柴山等,境内有沂河、响河、洪河、蓼河4条主要河流。土壤土层厚，粘性大，水位深，且大部分为蒙金土壤，不粘不散，抗旱耐涝，保肥保水，宜耕性好，水利设施齐全，宜于瓜果、蔬菜等多种作物种植。境内有日东高速公路、曲尼公路、张土公路等三条主要道路,交通便利，建有电视差转台和2个35千伏变电所。通讯设施齐全,有邮政和电信支局，建有程控电话交换机和全球通移动电话中转发射塔。科教文化卫生机构齐全，建有市人民医院南辛分院，有3处中学,21处小学。
南辛镇河沙、矿石资源丰富,辛庄村矿山可生产700号高标号水泥,储量1亿立方米。官庄村产优质天然矿泉水，年开采量50万吨，已通过国家地质矿产部批准生产，并以地环矿水发[1994]205号文公布。特产主要有彭庄石榴、日本大葱、罗非鱼、尼山砚等。现正于尼山风景区开发建设中国圣水城。境内生态环境良好，碧水清山，尼山水库总蓄水能力1.2亿立方米,是曲阜市兖州市地表水和地下水的主要来源。南辛镇是休闲旅游、投资兴业、生产绿色食品的理想之地。
四基山观音庙
四基山观音庙，位于曲阜市尼山镇大烟庄村南四基山上，始建于明代。清代多次进行维修，庙在山套内，东、西、南三面环山，北面为山口，由此进山往南约500米处，即是庙院。庙院靠西山根，坐北面南，前后三
尼山水库水利设施
尼山水库水利设施（1）位置：曲阜市尼山镇刘家楼村。（2）保护范围：以坝体为中心（大坝中心：北纬35°29′30.5″，东经117°11′46.5″），向东30米，向西20米，向南、北各1
曲阜白村遗址
白村遗址（1）位置：曲阜市尼山镇西白村。（2）保护范围：以坐标点（35°30’40.60，117°09’26.9）为基点向东、西各180米，向南北各100米。（3）建设控制地带：保护范围外1
“五四”青年洞
“五四”青年洞（1）位置：曲阜市尼山镇黄土村胡家山。（2）保护范围：南、北洞口外各30米。（3）建设控制地带：按特殊控制地带控制管理，保持山体的自然风貌。
迎坤桥
迎坤桥（1）位置：曲阜市尼山镇桑庄村。（2）保护范围：桥周围5米以内。（3）建设控制地带：保护范围外50米。
历史沿革：
建国前，镇内村庄除屯里、大胡村东西大街以北属曲阜外，其余皆归属邹县管辖。
南部村庄属土旺社，北部属大胡社，东部属鲁源社。
民国时期为邹县二区。
1945年12月划归曲阜第五区。
1946年4月，曲泗县第五区公所改称曲阜县第五区公所，机关驻南辛村。
1948年7月，邹县南辛区划归曲阜县。
1949年为南辛区，下设13个乡。
1950年8月，南辛区委改称第五区委。
1955年5月又改为南辛区委。
区委驻南辛村。
1956年8月，南辛区下设南辛、魏庄、夏宋、息陬4个乡。
1958年9月成立南辛人民公社。
原南辛区及所辖的南辛、魏庄乡撤销。
1965年8月，人民公社体制调整，原南辛人民公社改称南辛区。
下设南辛、余村、鲁源、曼山、魏庄5个公社。
1968年，区改为公社，原5个公社改称生产管理区。
1970年成立尼山公社，1984年5月公社改区，南辛区辖南辛镇、尼山乡、曼山乡。
1985年10月尼山乡从南辛区划出，列为县直属乡，辖3个管理片、19个行政村。
1986年6月撤县改市，南辛区改称镇，辖3个管理片、23个行政村。
2000年12月，乡镇规模调整，原尼山乡、原南辛镇合并组成新的南辛镇，辖南辛、曼山、余村、库西、库南、库北6个管理片，42个行政村。
2011年5月18日，经山东省人民政府（鲁政函民字〔2011〕18号文）批准，将南辛镇更名为尼山镇至今。
2020年行政村建制优化后辖29个村委会。