地名由来：境内有山形似舟，故名。

2022年9月，浙江省爱卫办公布舟山镇为2021年度浙江省省级健康乡镇。

2021年12月，浙江省民政厅认定舟山镇为浙江省革命老区乡镇（街道）。

2021年5月，舟山镇被列入2021年度浙江省美丽城镇建设样板创建名单（文旅特色型）。

2020年7月，全国爱卫会命名舟山镇为2017-2019周期国家卫生乡镇（县城）。

2019年1月，舟山镇被认定为2018年度浙江省美丽乡村示范乡镇。

永康市辖镇。1949年设舟山乡，后改公社，1983年复改乡，1992年改镇。位于市境东南部边境，距市区19公里。面积39.7平方公里，人口1.2万。金临公路、舟(山)新(楼)公路过境。辖舟一、舟二、舟三、坦郑、端头、台门、白岩下、沅口、石塘徐、洪茂、下东桥、陆宅、上桥、前村、申亭、白沙、花古、大塔、溪塘、后畈、清源、道坦、马关23个村委会。农业主种水稻，有玉米、小麦、番薯、早豆等作物。工业有电动工具、电器、铸造、纺织、五金、萤石等门类。副业以加工条石、石雕为多，有条石之乡美称。

历史沿革：

清时属武平乡，民国时为云源乡和四靖乡，而后2乡合并称云靖乡，解放后统称舟山乡。

1950年分舟山、前村2个乡，1956年方丘、新楼两乡合并为新楼乡。

前村、舟山合并复称舟山乡，1958年舟山乡称舟山管理区，曾称跃进人民公社，后称新楼管理区。

1961年舟山管理区改为舟山公社，1983年复称舟山乡，1992年3月撤乡建镇称舟山镇；2001年舟山镇并入石柱镇，称舟山管理处。

是年7月，古山、胡库、新楼、方岩四个乡合并，建立古山镇，新楼设管理处。

2006年6月，新楼管理处从古山镇分出与舟山管理处从石柱镇分出后合并，设立舟山镇，名称沿用至今。