地名由来：因镇政府驻地位于玉皇庙村，故名玉皇庙镇。

2023年4月，山东省住房和城乡建设厅确定玉皇庙镇为山东省小城镇创新提升行动试点镇（卫星镇）。

2023年3月，玉皇庙镇被认定为山东省首批绿色能源发展标杆乡镇。

2023年3月，农业农村部推介玉皇庙镇为2022年全国乡村特色产业产值超十亿元镇（番茄）。

2021年10月，农业农村部遴选推介玉皇庙镇为2021年全国乡村特色产业十亿元镇。

2020年12月，山东省农业农村厅公布2020年山东省农业产业强镇名单，玉皇庙镇榜上有名。

2020年11月，农业农村部认定玉皇庙镇为第十批全国一村一品示范村镇（番茄）。

2020年7月，全国爱卫会命名玉皇庙镇为2017-2019周期国家卫生乡镇（县城）。

2019年12月，玉皇庙镇被认定为第一批山东省乡村振兴示范乡（镇、街）。

2017年12月，玉皇庙镇入选2017年山东省卫生乡镇名单。