地名由来：王店镇名，始于五代后晋天福年间。天福二年（937），嘉兴镇遏使王逵居此，植梅百亩，聚货交易，始称王店。（《嘉禾志》）。后箸缨相继，日渐殷庶，逐成巨镇（《梅里志》）。至明中叶，此地镇民之居，夹河成聚，为里者三，成为嘉兴四大名镇之一。自唐至清，镇东为大彭乡，西为嘉会乡，镇跨两乡之间。宣统初元，自治之议起，乃划各庄以属之，名曰王店镇区（《梅里备志》）。辛亥革命后，虽几经兵灾，仍为货物集散地。解放初，建制为王店镇，故名。

2022年3月，嘉兴现代物流园（王店镇）被命名为2021年度嘉兴市平安镇（街道）。

2022年1月，嘉兴现代物流园（王店镇）入选2021年智慧健康养老示范街道（乡镇）名单。

2021年10月，嘉兴现代物流园（王店镇）上榜2021年全国千强镇名单，排名第198位。

2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，嘉兴现代物流园（王店镇）榜上有名。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，嘉兴现代物流园（王店镇）榜上有名。

2020年7月，全国爱卫会命名嘉兴现代物流园（王店镇）为2017-2019周期国家卫生乡镇（县城）。

2019年10月，2019年度全国综合实力千强镇榜单公布，嘉兴现代物流园（王店镇）位列第522名。

2019年1月，嘉兴现代物流园（王店镇）被认定为2018年度浙江省美丽乡村示范乡镇。

2017年8月，嘉兴现代物流园（王店镇）被国家住房和城乡建设部认定为第二批全国特色小镇。