南芹村位于古店乡东南部，东邻友谊村、王大村，北邻北芹村，南邻顾桥镇，西与东林村、新河村隔河相望。老凤利路、泥古路贯穿全村。

全村共有413户，人口1489人，耕地2193亩。5个自然庄，10个村民组。2010年全村农村经济总收入700万元，农民人均纯收入5106元。土地肥沃，新农村建设基本实现规范化。共有一个党支部，4个党小组，30名党员，其中女党员2个，预备党员3名，培养积极分子3名，预备党员转正3名。

南芹村与北芹村、古店村、前刘村、童集村、友谊村、北王集村、王大村、东林村、童圩村、米集村、西林村、新河村相邻。

南芹村附近有焦岗湖影视城、淮南市焦岗湖旅游景区、八公山国家地质公园、凤台县茅仙洞旅游区、凤台县白塘庙革命活动纪念园、茨淮新河水利风景区等旅游景点，有凤台淮王鱼、马店糯米、蒸香菇盒、顾桥双喜陈醋、顾桥陈醋、淮南豆腐干等特产，有凤台花鼓灯、火老虎、谢郢锣鼓、淮河大鼓、淮南牛肉汤制作技艺、马戏灯等民俗文化。