地名由来：明初，郑氏祖由山西洪洞县初迁封王庙，后转迁于此，因村中有一玉皇庙，故名。因政府驻玉皇庙村而得名。

玉皇庙镇位于郓城县城西12.5公里；全镇总面积90平方公里，辖58个行政村，85个自然村；53000人，5867公顷耕地，水浇面积达90%以上。该镇东临京九铁路郓城站、郓苏公路横贯全境，西靠宋江故里和孙膑故里，交通便利，文化悠久。该镇始终把农业作为基础产业来抓，实施科教兴农战略农业科技含量逐年增加，镇党委政府以全面振兴经济为中心，大力时行产业结构调整；民展优质、高产、高效创汇产业，有优质大蒜、美国黑提、红提葡萄、芦笋、双孢菇、大棚蔬菜等1333公顷，植桑面积200公顷。有镇办企业3家，民营企业420家，外商投资企业7家，2001年全镇实现工业总产值6200万元，比1998年增长22%，实现工农业总收入17900万元，人均纯收入2270元。

历史沿革：

民国属郓城县八区。

1958年属水堡人民公社（公社机关驻玉皇庙），1961年以驻地命名为玉皇庙人民公社。

1984年撤社建乡时，设立玉皇庙镇。

2001年2月撤销刘口乡，并入玉皇庙镇。