地名由来：高店镇因所在地地势高、曾有车马店而命名为高店。

2021年4月，高店镇入选农业农村部、财政部2021年农业强镇创建名单。

2012年11月，农业部认定高店镇为第一批全国一村一品示范村镇（乐都紫皮大蒜）。

高店乡位于县境西端，距县府驻地18千米。人口0.9万，以汉族为主，还有土、回、藏族等。总面积70平方千米。辖东门、西街、峡口、大峡、河滩、湾子、河滩寨、俞家、柳树湾、下杨家、上杨家11个村委会。民国时置复兴乡，1950年沿旧制设高店乡，1958年并入汉庄公社，1961年分设高店公社，1984年复设高店乡。

历史沿革：

民国时期，置复兴乡。

1950年，设高店乡。

1958年，并入汉庄公社。

1961年，分设高店公社。

1984年，复设高店乡。

2001年3月19日，撤销高店乡，设立高店镇。