地名由来：以其境内的百花湖而得名。

2022年12月，百花湖镇被贵州省林业局命名为2022年贵州省森林乡镇。

2020年7月，全国爱国卫生运动委员会重新确认百花湖镇为2020年国家卫生乡镇（县城）。

2014年9月，环境保护部授予百花湖镇2012年—2013年度国家级生态乡镇称号。

在清镇市东部。面积109平方公里。人口1.6万，其中苗、布依等民族占9.4%。辖16村委会。1949年为五里乡。1953年析设五里、麦格、三屯3乡。1958年撤乡建五里改公社。1961年析建百花、云归2公社。1984年改设乡。1991年合并置百花湖乡。有硅石、铝等矿藏。有中小学18所。百花湖为省级风景名胜区，云归山为清镇八景之一。镇人民政府驻地百花湖，在红枫湖镇东北15公里，百花湖畔。人口530，有汉、苗等民族。海拔1230米。1960年五里桥被水库淹没后迁此，曾沿用五里桥名。清镇—百花湖公路终点。

历史沿革：

民国三十二年（1943年），为五里乡。

1953年，分为五里、桂花两个乡。

1958年，为三屯、中心、桂花三个生产管理区。

1961年，为五里公社。

1963年，分出桂花公社。

1967年，分出云归公社。

1984年，为百花湖乡。

1992年，由原五里区百花湖乡和云归乡合并为百花湖乡。

2011年11月15日，从清镇市划出，隶属观山湖区。

2017年7月，贵州省政府同意撤销观山湖区百花湖乡，设立百花湖镇。