地名由来：在妙镇因靠近明江河，故时常遭水淹，人们在此立庙求祈称为驮庙，即水庙之意，后建村寨即称“庙”。1940年圩上知名人士将“寨庙”改为同音“在妙”。因镇政府驻地位于原名在妙圩而得名。

2022年4月，在妙镇入选2022年农业产业强镇创建名单。

2019年11月，在妙镇上榜广西2019年度自治区级生态乡镇名单。

在妙镇位于上思县西部，距县城35公里，西与宁明县那堪乡接壤，北靠四方山与扶绥县交界，南邻平福乡，东连七门乡，属边境区域，低丘陵盆地。全镇总面积96平方公里，耕地面积48117亩，其中水田12040亩，旱地36077亩，林地面积44675亩，辖6个村委会69个自然屯，总人口18076人，其中农业人口16706人，非农业人口1370人。居住有壮、汉、瑶等民族，其中壮族人口73%。在妙镇旅游资源丰富，主要景点有屯隆村牛岩、水岩、通天岩和驮从村那蒙天主教堂等。矿产资源有磷矿、石灰石等。在妙镇交通便利，是上思、宁明、扶绥、崇左4县（市）交界枢纽重镇.20274国道与明江河道横穿腹部，国防公路通平福过华兰南下东兴。全镇已实现村村通公路，蔗区公路形成网络，贯通全镇各村屯。在妙镇于1994年撤乡设镇，在圩场北面成立开发区，开发区占地240多亩，路网整齐。镇自来水厂始建于70年代，现在日供水1000立方。安装有一台200千伏变压器，电力供应充沛。目前已开通了移动电话及小灵通业务，全镇程控电话用户超过2000户，移动电话超过1500台，已实现村村通电话、村村通广播电视。1995年建成沧州市场（长500米、宽28米），2002年建成在妙码头，基础设施日渐完善。近年来，在妙镇紧紧抓住西部大开发的大好机遇，努力发展各项社会事业，加快城镇建设的步伐。2003年全镇甘蔗种植面积3.2万亩，蔬菜种植面积1万亩，现在甘蔗、蔬菜已成为全镇经济发展的主导产业。全镇国民生产总值116600万元，农业总产值6592万元，粮食总产量6520吨，地方财政收入201.58万元，农民人均收入1913元，人均备粮383.5公斤。乡镇企业蓬勃发展，全镇个体工商户和私营企业发展到680家，从业人员有1350人，年产值达9185万元，实现利润1474万元。集贸市场繁荣，2003年底圩场摊点共600个，从业人员735人，每逢过节圩场商贾云集，赶圩人数超万人。主要交易商品有猪仔、粮油、家电、成衣、布匹、农副产品、家禽等。去年，在妙镇根据自治区社会治安综合治理"三十百千"工程的要求，着力解决了治安突出的问题，初步形成了社会治安"打防控"的格局，现在全镇社会治安稳定，人民群众安居乐业。在妙镇党委、政府将以饱满的热情，更加优惠的政策，真诚欢迎各界朋友来我镇投资兴业，共谋发展。