地名由来：淮河小蚌埠段是古代采珠之地。明清时期，很多商贩在河岸上做小生意，天长日久，便有人在淮堤北岸设一条商业小街，因街正东正西，取名正街；淮河南岸建有几家小店，称蚌埠集。清同治二年（1863），凤阳府在小蚌埠正街设立“三县司衙”，属凤阳直管，负责管理蚌埠全境行政治安之事，这是第一次挂着“蚌埠”招牌的地方行政机构。此时，淮河北岸正街比南岸蚌埠店繁盛，故称之为“小蚌埠”。

2020年7月，全国爱卫会命名小蚌埠镇为2017-2019周期国家卫生乡镇（县城）。

2011年12月，小蚌埠镇上榜第三届全国文明村镇名单。

蚌埠市郊区辖镇。1949年设小蚌埠镇，1958改公社，先后称淝淮和小蚌埠公社，1984年改小蚌埠乡，1992年小蚌埠、吴郢两乡合并置小蚌埠镇。位于市区北，淮河北岸，距市府7公里。淮河沿镇而过，京沪铁路过境。蚌(埠）阜(阳）、蚌(埠）宿(县）、怀(远）五(河）等公路交叉于境内。有淮河轮渡直通南岸市区中心。辖方沟、吴庵、赵宗、高庵、陈台、后楼、芦台、山香、金台、桃园、东赵、果园、林场、东庙、丁岗、双墩、吴郢、徐岗、小蚌埠、芦小庙、王小沟21个村委会。农业以小麦、水稻、蔬菜种植为主。工业以化工、建筑、建材为主。

小蚌埠镇地处淮河北岸，与蚌埠市老城区隔河相望，为蚌埠市淮上区人民政府所在地。全镇总面积42.3平方公里，辖18个村民委员会，5个社区，总人口5.2万人。全镇共有党组织59个，其中村党组织32个，党员1239名。

小蚌埠镇地理位置优越、交通便利，解放路公路桥、朝阳路公路桥、大庆路公路桥、206国道、蚌宁高速公路、307省道均在境内。小蚌埠镇具有丰厚的历史文化底蕴，双墩遗址距今已有7300多年，境内还有春秋钟离古墓、龙华禅寺等名胜古迹。

双墩遗址

双墩遗址，位于安徽省蚌埠市淮上区小蚌埠镇双墩村北，该文化遗物距今约7000年左右，是目前淮河中游地区已发现的年代最早的新石器时代文化遗存，是淮河流域早期文明有力证据。双墩遗址出土有刻画符号的

历史沿革：

1947年元旦，设市辖小蚌埠区公所；1949年1月20日，改为小蚌埠区政府（10月成立小蚌埠区人民政府）；1958年9月与路东、路西乡合并成立卫星公社；1959年2月改为淝淮公社；1964年11月改为小蚌埠公社；1984年2月改为小蚌埠乡；1992年2月，吴郢乡、小蚌埠乡合并为小蚌埠镇，隶属蚌埠郊区；2004年区划调整划入淮上区，沿用至今。